Open Access
Tableau I.
Résumé de différentes techniques de mise en évidence des protéines de liaison aux ARN associées aux génomes viraux centrées sur l’ARN et leurs caractéristiques.
| Nom | Acronyme | Pontage | Virus | ARN péché | Exemple | Références |
|---|---|---|---|---|---|---|
| RNA interactome capture (Capture de l'interactome ARN) | RNA-IC | Oui (UV) | SINV, SARS-CoV2 | ARN viral et cellulaire | Complexe ARNt ligase | [51–55] |
| Comprehensive identification of RNA bnding proteins-mass spectrometry (Identification complète des protéines de liaison de l'ARN par spectrométrie de masse) | ChIRP-MS | Oui (formaldehyde) | DENV, ZIKV, SARS-CoV2 | ARN viral génomique | HRNP-NA2B1, ILF3, QKI, SFPQ | [58] |
| Viral cross-linking and solid-phase purification ( Réticulation virale et purification en phase solide) | VIR-CLASP | Oui (UV) | CHIKV, IAV, ZIKV, VSV | ARN viral génomique entrant | FASN, YTHFD1 | [59] |
| RNA-protein interaction detection (Détection des interactions ARN-protéines) | RapID | Non | ZIKV | ARN viral génomique | QKI | [62] |
| Double stranded RNA immunoprecipitation followed by mass spectrometry (Immunoprécipitation de l'ARN double brin suivie d'une spectrométrie de masse) | DRIMS | Non | SINV | ARN double brin viraux produits lors de la réplication et ARN double brin cellulaires | SFPQ, DDX5 | [63,64] |
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