La particule virale HDV infectieuse est une particule chimérique entre des composants externes fournis par le virus de l’hépatite B auxiliaire et des composants internes propres. Au sein de l’enveloppe membranaire sont ancrées les protéines et glycoprotéines de surface du virus HBV (AgHBs). La grande protéine L-AgHBs est indispensable pour que la particule soit infectieuse. La ribonucléoprotéine HDV interne n’a pas la solidité classique des capsides virales. Elle est composée de polymères des deux formes de protéines delta associées à l’ARN viral génomique circulaire sous forme pseudo-double brin, alternant des zones parfaitement appariées et des petites boucles conférant à la molécule d’ARN une certaine flexibilité. Pour que la particule soit infectieuse, il faut que le génome code la petite protéine delta indispensable à la réplication, bien que dépourvue d’activité polymérase.