Comparaison des différentes approches de phosphoprotéomique quantitative applicables à l’analyse de tumeurs. Sur ce schéma sont représentés les échantillons à comparer (tumeurs ou cellules) marqués par isotope (en rouge) ou non marqués (en bleu foncé), ainsi que l’étape durant laquelle les échantillons sont mélangés (très précocement pour les marquages métaboliques comme le super-SILAC et le SILAC in vivo, après l’obtention des peptides pour le marquage chimique ou au cours de l’analyse de données pour les conditions sans marquage). L’analyse des données quantitatives est faite à partir des spectres MS1 (intensité du signal peptidique) ou des spectres MS2 (signal des rapporteurs libérés lors de la fragmentation des peptides marqués chimiquement). Cette représentation est adaptée de [30].