Les chimiothèques ciblant les interactions protéine-protéine

Chemical libraries dedicated to protein-protein interactions

¹ Molécules thérapeutiques in silico (MTi), université Paris Diderot, Inserm UMR-S973, 35, rue Hélène Brion, 75205 Paris Cedex 13, France
² Centre de recherche en cancérologie de Marseille (CRCM), CNRS UMR7258 ; Inserm U1068 ; institut Paoli-Calmettes ; université d’Aix-Marseille UM105, 27, boulevard Lei Roure, 13009, Marseille, France

^* philippe.roche@inserm.fr

Résumé

Les interactions protéine-protéine sont impliquées dans de nombreux processus cellulaires, ainsi que dans leur dysfonctionnement, ce qui en font des cibles thérapeutiques de choix. Toutefois, la conception de composés capables de moduler ce type d’interactions reste difficile et requiert la mise en place d’outils spécifiques, permettant d’accélérer les campagnes de développement de molécules bioactives et de diminuer leur coût. Les succès récents ont permis de caractériser certaines propriétés structurales et physicochimiques des interfaces protéine-protéine, ce qui a abouti à une possibilité d’inhibition de ces interactions par des petites molécules chimiques non peptidiques, ainsi qu’à la définition d’un profil caractéristique des composés chimiques associés. Dans cette revue, nous présentons le développement de collections de composés dédiées à ces cibles innovantes.

Abstract

The identification of complete networks of protein-protein interactions (PPI) within a cell has contributed to major breakthroughs in understanding biological pathways, host-pathogen interactions and cancer development. As a consequence, PPI have emerged as a new class of promising therapeutic targets. However, they are still considered as a challenging class of targets for drug discovery programs. Recent successes have allowed the characterization of structural and physicochemical properties of protein-protein interfaces leading to a better understanding of how they can be disrupted with small molecule compounds. In addition, characterization of the profiles of PPI inhibitors has allowed the development of PPI-focused libraries. In this review, we present the current efforts at developing chemical libraries dedicated to these innovative targets.