Chémobiologie (1)

Les chimiothèques et le criblage virtuel

Chemical databases and virtual screening

¹ Laboratoire d’innovation thérapeutique, UMR 7200 CNRS-université de Strasbourg, MEDALIS drug discovery center , 74, route du Rhin, F-67400 Illkirch, France
² Institut de chimie organique et analytique (ICOA), UMR CNRS-université d’Orléans 7311, université d’Orléans, rue de Chartres, F-45067 Orléans Cedex 02, France

^* rognan@unistra.fr

Résumé

Le préalable indispensable à tout criblage virtuel est la définition de la ou des chimiothèques à cribler. Comme nous le verrons ici, de nombreuses sources sont disponibles et leur sélection, ou non, dépendra du projet dans lequel le criblage virtuel s’insère. Cette étape de sélection est au moins aussi importante que la méthode de criblage elle-même. Cette revue détaille les principales chimiothèques utilisables à des fins de criblage virtuel, et oriente le lecteur vers le meilleur choix possible en fonction de ses besoins.

Abstract

A prerequisite to any virtual screening is the definition of compound libraries to be screened. As we describe here, various sources are available. The selection of the proper library is usually project-dependent but at least as important as the screening method itself. This review details the main compound libraries that are available for virtual screening and guide the reader to the best possible selection according to its needs.