Figure 3
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Visualisation après réduction de dimensions par t-SNE. La réduction de dimensions permet de visualiser, comme sur une carte géographique, l’appartenance d’une tumeur à un groupe de tumeurs. Chaque nuage de couleur correspond à un type ou sous-type tumoral, caractérisé par un profil de méthylation spécifique. La croix (indiquée par la flèche rouge) correspond à la tumeur étudiée. À droite, figure le code couleur avec le nom de différents types ou sous-types tumoraux présents dans la base de données. La tumeur étudiée se classe dans le groupe des glioblastomes IDH-non mutés, sous-type RTK1. L’algorithme utilisé ne peut classer correctement la tumeur étudiée que si des tumeurs de même nature (aux profils de méthylation similaires) sont présentes dans la base de données. Si le groupe est absent de la carte géographique, la tumeur se placera de façon aberrante dans un autre groupe. La liste des abréviations des diagnostics est disponible sur le site du DKFZ3.
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