La région promotrice du génome HDV est située en regard d’une extrémité du génome sous sa forme pseudo-double brin près du nucléotide 1640 de la boucle terminale. Ici, sont schématisés l’ARN sous sa forme pseudo-double brin, des protéines du complexe de remodelage de type ISWI (imitation switch) comprenant une protéine régulatrice BAZ2B et une ATPase (SNF2L et/ou SNF2H) qui sont susceptibles de participer au complexe de pré-initiation de la transcription (PIC) de l’ARN Pol II et des facteurs de transcription associés (à gauche). L’adénosine 1630, site d’initiation de la transcription de l’ARN messager, est marquée en rouge. S-HDAg phosphorylée contribuerait également à lever l’arrêt de l’élongation de Pol II en déstabilisant le complexe NELF (negative elongation factor)-DRB sensitivity inducing factor (DSIF), en entrant en compétition avec la sous-unité NELF-A. Sur l’ARN, S-HDAg est représentée artificiellement sous forme d’octamère. Les tailles respectives de l’ARN viral et des protéines ne sont pas à la même échelle.