Tableau I.
Les différentes séquences répétées dans le génome humain. Les séquences répétées peuvent être classées en deux catégories: les répétitions en tandem et les répétitions dispersées. Ce Tableau reprend les différentes répétitions retrouvées chez l’homme et la fraction du génome qu’elles représentent (adapté de [1,52–55]). *Les microsatellites peuvent être classés dans les deux catégories puisqu’il s’agit de répétitions en tandem présentes à de multiples endroits dans le génome.
Répétitions en tandem | |||||
Longueur d’une unité | Longueur de la région (environ) | % du génome | |||
Télomères | 6 pb | 10-15 kb | 0,01 | ||
Paralogues en tandem | rDNA | 45 kb | 50 kb-6 Mb | 0,32 | |
Duplications segmentales | 1-400 kb | 1 kb-5 Mb | 6,60 | ||
Microsatellites (STR)* | 2-6 pb | 10-100 pb | 3,20 | ||
Minisatellites (VNTR) | 10-100 pb | 100 pb-20 kb | |||
Satellites (centromères et péricentromères) | Satellite alpha | 171 pb | 0,2-8 Mb | 6,20 | |
Satellite beta | 68 pb | 0,2 kb-2 Mb | |||
Satellite gamma | 220 pb | 11-121 kb | |||
Satellite humain 1 | 42 pb | 0,2 kb – 5 Mb | |||
Satellite humain 2 | Variable | 1 kb – 13 Mb | |||
Satellite humain 3 | Variable | 1 kb – 28 Mb | |||
Satellite humain 4 | 35 pb | 0,7-48 kb | |||
Satellite humain 5 | 14-15 pb | 0,5-6 kb | |||
Macrosatellites | 100 pb-5 kb | 300 kb | 0,10 | ||
Mégasatellites | 1-5 kb | 400 kb | |||
Répétitions dispersées |
|||||
Nombre de copies | % du génome | ||||
Rétrotransposons | Non-LTR | LINE | LINE-1 | 560 799 | 16,77 |
LINE-2 | 372 147 | 3,41 | |||
autres | 66 306 | 0,50 | |||
SINE | Alu | 1 148 496 | 10,09 | ||
MIR | 539 657 | 2,65 | |||
autres | 8 822 | 0,03 | |||
SVA | 6 632 | 0,15 | |||
LTR | HERV | Classe I | 124 575 | 2,73 | |
Classe II | 8 570 | 0,28 | |||
Classe III | 120 330 | 1,93 | |||
MaLR | 258 048 | 3,63 | |||
Gypsy | 18 542 | 0,16 | |||
autres | 12 402 | 0,10 | |||
Transposons ADN | hAT | 313 620 | 2,08 | ||
Tc-1/Mariner | 129 286 | 1,40 | |||
autres | 14 371 | 0,02 | |||
Microsatellites (STR)* | 1 600 000 | 3,00 |
Current usage metrics show cumulative count of Article Views (full-text article views including HTML views, PDF and ePub downloads, according to the available data) and Abstracts Views on Vision4Press platform.
Data correspond to usage on the plateform after 2015. The current usage metrics is available 48-96 hours after online publication and is updated daily on week days.
Initial download of the metrics may take a while.