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Tableau I.

Les différentes séquences répétées dans le génome humain. Les séquences répétées peuvent être classées en deux catégories: les répétitions en tandem et les répétitions dispersées. Ce Tableau reprend les différentes répétitions retrouvées chez l’homme et la fraction du génome qu’elles représentent (adapté de [1,5255]). *Les microsatellites peuvent être classés dans les deux catégories puisqu’il s’agit de répétitions en tandem présentes à de multiples endroits dans le génome.

Répétitions en tandem
Longueur d’une unité Longueur de la région (environ) % du génome

Télomères 6 pb 10-15 kb 0,01

Paralogues en tandem rDNA 45 kb 50 kb-6 Mb 0,32

Duplications segmentales 1-400 kb 1 kb-5 Mb 6,60

Microsatellites (STR)* 2-6 pb 10-100 pb 3,20

Minisatellites (VNTR) 10-100 pb 100 pb-20 kb

Satellites (centromères et péricentromères) Satellite alpha 171 pb 0,2-8 Mb 6,20

Satellite beta 68 pb 0,2 kb-2 Mb

Satellite gamma 220 pb 11-121 kb

Satellite humain 1 42 pb 0,2 kb – 5 Mb

Satellite humain 2 Variable 1 kb – 13 Mb

Satellite humain 3 Variable 1 kb – 28 Mb

Satellite humain 4 35 pb 0,7-48 kb

Satellite humain 5 14-15 pb 0,5-6 kb

Macrosatellites 100 pb-5 kb 300 kb 0,10

Mégasatellites 1-5 kb 400 kb

Répétitions dispersées
Nombre de copies % du génome

Rétrotransposons Non-LTR LINE LINE-1 560 799 16,77

LINE-2 372 147 3,41

autres 66 306 0,50

SINE Alu 1 148 496 10,09

MIR 539 657 2,65

autres 8 822 0,03

SVA 6 632 0,15

LTR HERV Classe I 124 575 2,73

Classe II 8 570 0,28

Classe III 120 330 1,93

MaLR 258 048 3,63

Gypsy 18 542 0,16

autres 12 402 0,10

Transposons ADN hAT 313 620 2,08

Tc-1/Mariner 129 286 1,40

autres 14 371 0,02

Microsatellites (STR)* 1 600 000 3,00

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