Figure 1.

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Mécanisme de la catalyse de la dernière étape de biosynthèse conduisant à la modification t6A par le complexe KEOPS. (1) Synthèse du TC-AMP (thréonyl-carbamoyle-AMP) : YRDC catalyse la synthèse du TC-AMP à partir de la thréonine, du bicarbonate et de l’ATP. Cette étape conduit à la production d’un TC-AMP instable et à la libération de pyrophosphate inorganique. (2) Liaison de l’ARNt et du TC-AMP au complexe KEOPS : le TC-AMP se lie au site actif d’OSGEP et interagit directement avec l’atome de fer via la partie thréonyle de la molécule. La liaison de l’ARNt au complexe induit des changements de conformation dans ce dernier, y compris le déplacement de l’extrémité C-terminale de TP53RK (TP53 regulating kinase) (indiqué par une flèche rouge). LAGE3 et OSGEP sont impliqués dans la plupart des contacts (triangles gris et *) avec l’ARNt, tandis que TP53RK est impliquée dans la liaison de l’ARNt par son extrémité C-terminale. Une boucle anticodon portant le nucléotide cible A37 est positionnée à l’entrée de la cavité du site actif de l’OSGEP, près de l’intermédiaire TC-AMP et de l’atome de fer. (3) Transfert du L-thréonyl-carbamoyl à l’ARNt : la fraction L-thréonyl-carbamoyl est transférée à l’A37 de l’ARNt du substrat indépendamment de l’ATP, et l’AMP est libéré. (4) Libération de l’ARNt modifié en 6A : l’hydrolyse de l’ATP catalysée par TP53RK entraîne des changements de conformation, en particulier le déplacement de l’extrémité C-terminale de TP53RK (indiquée par la flèche rouge), ce qui conduit à la dissociation de l’ARNt modifié du complexe KEOPS. Le complexe KEOPS résultant est alors compétent pour un autre cycle catalytique (adapté de [18]).
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