Comparaison des structures tridimensionnelles des PNGases de levure et humaine. La PNGase de Saccharomyces cerevisiae (ScPng1p) est codée par le gène PNG1 : le domaine central transglutaminase, qui comporte le site actif (en bleu foncé), et les deux motifs thioredoxin-like CXXC de liaison au zinc (dont les acides aminés sont indiqués en rouge), constituent une structure hautement conservée qui est commune à toutes les espèces. Un agrandissement du site actif de ScPng1p montre que la triade catalytique (C¹⁹¹, H²¹⁸ et D²³⁵) se situe au fond d’une structure qui a la forme d’un sillon. Le modèle tridimensionnel de la PNGase humaine (HsNgly1p) a été construit à l’aide du logiciel Modeller v9.11 (http://salilab.org/modeller/) en se basant sur l’homologie de séquence des différents domaines de HsNgly1p, de l’enzyme murine (PUB, pdb 2CCQ et 2D5U ; PAW, pdb 2C9G) et du complexe murin PNGaseI/HR23 (pdb 2F4M). La PNGase de mammifère est codée par le gène NGLY1 : en plus du domaine transglutaminase, elle comporte, respectivement, aux extrémités amino- et carboxy-terminales, le domaine PUB (en jaune, domaine d’interaction protéique) et le domaine PAW (en vert, domaine de liaison aux résidus de mannose).