Génotype, environnement, phénotype intermédiaire, phénotype final. Schéma simplifié représentant des espaces de paramètres du génotype (bleu), de l’environnement (vert) et du phénotype final (orange). L’écologie et la structure des populations déterminent la position d’un organisme en développement dans l’espace des paramètres génétiques et environnementaux. La construction du phénotype final passe par un système biologique (interactions cellulaires, expression de gènes, etc.) qui peut lui-même être représenté par un espace de paramètres (phénotype intermédiaire ou endophénotype, saumon). Un phénotype intermédiaire peut par exemple être la position respective de cellules, ou la concentration d’une molécule. En une boucle de rétroaction, le phénotype final influe sur l’écologie et la structure génétique de la génération suivante, en particulier via la sélection naturelle.