Figure 1.

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Approche événementielle et relativiste de l’information. A. Le processus d’intégration commence par la définition du problème biomédical devant être traité (cancer du sein dépendant de l’activation de l’oncogène ras, hypercholestérolémie familiale, détoxification d’une molécule déterminée, etc.), ce qui permet de définir des contextes physiopathologiques. B. Toutes les informations stockées dans les bases de données publiques ayant un lien quelconque avec ces contextes sont rapatriées et structurées sous forme de base de données indexée (en termes de composantes biologiques, d’interactions, d’interdépendances, etc.). Si des données expérimentales sont disponibles, elles sont injectées dans cette base de données et sont prises en compte dans une nouvelle indexation. C. Les arborescences de l’index sont ensuite visualisées et les éléments donnant naissance aux embranchements sont utilisés pour générer des hypothèses fonctionnelles. D. Chaque hypothèse ainsi générée est alors testée contre l’ensemble des bases de données publiques, le but recherché ici étant la destruction de l’hypothèse. E. Les éléments d’information permettant de la détruire sont alors utilisés, conjointement avec les éléments d’arborescence, pour générer une nouvelle hypothèse qui est à son tour soumise au processus de destruction et ainsi de suite, de façon itérative, jusqu’à obtention d’une hypothèse ne pouvant pas être détruite. F. Les hypothèses non détruites accumulées sont alors intégrées en méta-hypothèses qui sont à leur tour soumises au même processus de destruction. Ce procédé, qui est étonnamment rapide (moins d’un an pour une maladie complexe et largement incomprise telle que la maladie de Creutzfeldt-Jakob), amène à la construction d’un modèle biologique, souvent très détaillé et directement vérifiable par expérimentations indépendantes.
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