Figure 2.

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Les stratégies pour produire des ZF avec une spécificité de reconnaissance de l’ADN cible. A. La sélection parallèle est basée sur un fonctionnement indépendant des motifs ZF individuels dans les ZFP, chaque doigt de zinc individuel dans une ZFP interagit avec son site de reconnaissance indépendamment du doigt de zinc voisin. Chacun des doigts de zinc est donc sélectionné indépendamment des autres. B. Dans la stratégie de sélection séquentielle, les doigts de zinc individuels sont sélectionnés dans le contexte de ses voisins, et par conséquent, les contraintes dues à la nature de la séquence ADN cible sont prises en compte. Chacun des doigts de zinc est donc sélectionné successivement en fonction des doigts de zinc adjacents. C. La stratégie bipartite utilise deux banques ZFP pré-créées avec dans chacune la moitié des trois motifs ZF partiellement randomisée au niveau des acides aminés clés qui font le contact avec l’ADN. La partie amino-terminale de la ZFP est inter-changée à partir d’une banque pendant que la partie carboxy-terminale est inter-changée à partir d’une autre banque. La sélection est faite en parallèle en utilisant les moitiés 5’ et 3’, respectivement, de la séquence cible. Les sélections faites à partir des banques individuelles sont associées et sélectionnées une nouvelle fois en utilisant la séquence cible entière dans le but d’obtenir une ZFP avec la spécificité désirée et une bonne affinité de reconnaissance (d’après [25]).
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