Diversité et importance écologique des virus dans le milieu marin

Diversity and ecological importance of viruses in the marine environment

¹ Sorbonne Université, CNRS, FR2424, Station biologique de Roscoff, Roscoff, 29680, France
² Sorbonne université, CNRS, Station biologique de Roscoff, Laboratoire adaptation et diversité en milieu marin, UMR7144, Roscoff, 29680, France

^* cbachy@sb-roscoff.fr

Résumé

L’océan est le réservoir le plus important de virus sur la planète avec des abondances allant jusqu’à plusieurs milliards par litre. Ces virus sont une force directrice majeure pour l’évolution et la structuration du monde microbien, mais aussi pour le fonctionnement des grands cycles biogéochimiques dans les écosystèmes marins. Grâce aux techniques de séquençage à haut débit, nous commençons à entrevoir la diversité et la complexité de cette virosphère marine. Cette synthèse décrit les découvertes importantes dans le domaine de l’écologie virale marine et aborde la diversité de ces micro-organismes fascinants, leur impact sur la mortalité microbienne et les cycles de nutriments et d’énergie dans l’océan.

Abstract

The ocean is the largest reservoir of viruses on the planet with estimates of up to several billions per liter. These viruses represent a major driving force not only for the evolution and for structuring the microbial world, but also for the functioning and the balance of marine ecosystems. With the advances in high throughput sequencing techniques, we are beginning to uncover the diversity and the complexity of this marine virosphere. This review synthesizes milestones in the field of marine viral ecology, including the diversity of these fascinating microorganisms, their impact on microbial mortality and cycling of nutrients and energy in the ocean.