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Med Sci (Paris)
Volume 34, Number 4, Avril 2018
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Page(s) | 319 - 325 | |
Section | Revues | |
DOI | https://doi.org/10.1051/medsci/20183404012 | |
Published online | 16 April 2018 |
Séquençage par nanopores
Perspectives d’applications en santé humaine
Prospects for applications in human health of nanopore-based sequencing
1
Gènes Diffusion, 3595, route de Tournai, 59501 Douai, France
2
Univ Lille, CNRS, Inserm, CHU de Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019-UMR 8204-CIIL-Centre d’Infection et d’Immunité de Lille, 1, rue du professeur Calmette, F-59000 Lille, France
3
Pegase-Biosciences, Institut Pasteur de Lille, 1, rue du professeur Calmette, 59019 Lille, France
* email: segolene.caboche@pasteur-lille.fr
Le séquençage haut-débit a ouvert de nouvelles perspectives cliniques nous orientant aujourd’hui vers une médecine de précision. Cancérologie, infectiologie ou génomique humaine, de nombreuses applications ont vu le jour ces dernières années. L’arrivée sur le marché d’une troisième génération de technologie de séquençage fondée sur les nanopores, palliant certaines faiblesses de la génération précédente, annonce une nouvelle révolution. Portabilité, temps réel, lectures longues et coût d’investissement marginal, ces nouvelles technologies prometteuses laissent présager un nouveau changement de paradigme. Quelles sont les perspectives ouvertes par les nanopores pour les applications cliniques ?
Abstract
High throughput sequencing has opened up new clinical opportunities moving towards a medicine of precision. Oncology, infectious diseases or human genomics, many applications have been developed in recent years. The introduction of a third generation of nanopore-based sequencing technology, addressing some of the weaknesses of the previous generation, heralds a new revolution. Portability, real time, long reads and marginal investment costs, these promising new technologies point to a new shift of paradigm. What are the perspectives opened up by nanopores for clinical applications?
© 2018 médecine/sciences – Inserm
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