Rétrotransposons et cellules somatiques

Parasites ou acteurs actifs du contrôle épigénétique ?

Retrotransposons: selfish DNA or active epigenetic players in somatic cells?

Inserm UMRS 1131, université Paris Diderot, institut universitaire d’hématologie (IUH), hôpital Saint-Louis, 1, avenue Claude Vellefaux, 75010 Paris, France

^* fabien.guidez@inserm.fr

Résumé

Les éléments transposables sont des séquences d’ADN endogènes mobiles constituant environ 40 % du génome humain. D’abord reconnus comme actifs dans les cellules germinales adultes, il apparaît qu’ils ont aussi une activité de transposition élevée dans les cellules somatiques. Leur implication directe dans les mécanismes oncogéniques s’avère cruciale dans la dérégulation de l’expression génique normale. De nouveaux mécanismes de régulation de leur expression ont été découverts montrant que leur silencing, par l’intermédiaire de modifications épigénétiques, dépend de gènes suppresseurs de tumeur.

Abstract

Transposable elements (TE) represent around 40% of the human genome. They are endogenous mobile DNA sequences able to jump and duplicate in the host genome. TE have long been considered as “junk” DNA but are now believed to be important regulators of gene expression by participating to the establishment of the DNA methylation profile. Recent advances in genome sequencing reveals a higher transposition frequency and TE driven gene expression in somatic cells than previously thought. As TE propagation is deleterious and may be involved in oncogenic mechanisms, host cells have developed silencing mechanisms mainly described in germinal and embryonic cells. However, somatic cells are also proned to TE transposition and use specific mechanisms involving tumor suppressor proteins including p53, Rb and PLZF. These transcription factors specifically target genomic retrotransposon sequences, histone deacetylase and DNA methylase activities, inducing epigenetic modifications related to gene silencing. Thus, these transcription factors negatively regulate TE expression by the formation of DNA methylation profil in somatic cells possibly associated with oncogenic mechanisms.