Lames virtuelles en pathologie

Technologie des lames virtuelles

De la numérisation à la mise en ligne

Whole slide imaging technology: from digitization to online applications

¹ Université Paris Diderot, Sorbonne Paris-Cité, Institut universitaire d’hématologie, laboratoire de pathologie, groupe hospitalier Saint-Louis Lariboisière Fernand-Widal, Inserm UMR-S 728, 1, avenue Claude Vellefaux, 75010 Paris, France
² Faculté de médecine Pierre et Marie Curie, groupe hospitalier Pitié-Salpêtrière, service d’anatomie et de cytologie pathologiques, unité d’imagerie morphologique (UIMAP), 83, boulevard de l’Hôpital, 75013 Paris, France
³ DIH-HUPO-APHP, Université Paris Descartes, Inserm UMRS 872 eq 20, 15, rue de l’école de médecine, 75006 Paris, France

^* david.ameisen@univ-paris-diderot.fr
^** gilles.lenaour@psl.aphp.fr
^*** christel.daniel@crc.jussieu.fr

Résumé

À l’heure où l’e-santé est une part essentielle de la médecine moderne, les lames virtuelles sont devenues un élément clé en anatomie pathologique. La microscopie virtuelle consiste en la numérisation de lames de verre à fort grossissement. Le pathologiste peut ainsi observer ces lames numérisées à très haute résolution sur un ordinateur distant comme s’il utilisait un microscope. Cet article décrit les principes technologiques et les outils informatiques pour numériser et visualiser les lames virtuelles localement ou en réseau. Il fait également le point sur les questions d’assurance qualité, de standardisation et d’intégration des lames virtuelles à grande échelle aux systèmes de soins, d’enseignement et de recherche.

Abstract

As e-health becomes essential to modern care, whole slide images (virtual slides) are now an important clinical, teaching and research tool in pathology. Virtual microscopy consists of digitizing a glass slide by acquiring hundreds of tiles of regions of interest at different zoom levels and assembling them into a structured file. This gigapixel image can then be remotely viewed over a terminal, exactly the way pathologists use a microscope. In this article, we will first describe the key elements of this technology, from the acquisition, using a scanner or a motorized microscope, to the broadcasting of virtual slides through a local or distant viewer over an intranet or Internet connection. As virtual slides are now commonly used in virtual classrooms, clinical data and research databases, we will highlight the main issues regarding its uses in modern pathology. Emphasis will be made on quality assurance policies, standardization and scaling.