Vers une standardisation des outils pour les études de protéomique clinique

Towards a standardization of the tools for the studies of clinical proteomics

Plate-forme Protéomique IFR-Santé-STIC, 8, boulevard de Lattre de Tassigny, 21000 Dijon, France

^* patrick.ducoroy@efs.sante.fr

Résumé

L’identification de marqueurs protéiques d’intérêt diagnostique ou pronostique a suscité de grands espoirs en oncologie. À l’heure actuelle, cependant, la protéomique clinique fondée sur l’analyse de profils protéiques dans les liquides biologiques se heurte à un défaut de sensibilité et de reproductibilité. Cela est dû au manque de standardisation des étapes pré-analytiques et analytiques. La taille de la cohorte de patients analysés est un autre paramètre essentiel pour donner de la puissance à l’analyse envisagée. Le recrutement d’une cohorte suffisante justifie les études multicentriques qui imposent l’analyse de la reproductibilité inter-plates-formes et la standardisation des étapes pré-analytiques et analytiques. Cette standardisation passe par la mise en place d’échantillons de référence.

Abstract

Proteins identified in biological fluids of cancer patients could be helpful for both diagnosis and prognosis. However, clinical proteomics based on analysis of protein profiles in biological fluids has demonstrated various flaws, most of them related to the difficulties met in reproducibility. These difficulties could be partly overcome by accurate standardisation of pre-analytical and analytical steps of these studies. The size of the patient cohort is one of the parameters that determine the powerfulness of the study. Recruitment of a cohort with a sufficient size often implies multicentric studies in which analysis of the reproducibility between centres and standardisation of pre-analytical and analytical steps are essential. Such a standardisation requires the use of calibrated samples as common references.