Deux modes d’évolution. A. Modèle lamarckien : par un processus de rétro-ingénierie utilisant l’information relative à l’environnement ou par extraction directe de l’ADN de cet environnement, une mutation utile à l’adaptation (favorable) est générée et se propage dans la population. B. Modèle darwinien : la diversité est générée indépendamment de l’effet favorable, neutre ou délétère des mutations. En fonction de l’intensité de la sélection, qui dépend des valeurs sélectives des différents génotypes et de la taille de la population, la mutation qui se fixe dans la population n’est pas nécessairement une mutation favorable. En effet, le hasard qui a un rôle très important dans les petites populations peut conduire à la disparition d’une mutation favorable ou à la fixation d’une mutation délétère. En revanche, dans une grande population, une mutation favorable aura une plus grande probabilité de se fixer (modifiée d’après Koonin et al. [5]).