Les différentes applications des ZF. Le mécanisme d’action des facteurs de transcription artificiels dépend du site ADN ciblé et du domaine effecteur (s’il y en a un) fusionné aux ZF (un rectangle orange représente un ZF). En l’absence de domaine effecteur (A), les ZF peuvent être utilisés comme des barrières naturelles vis-à-vis du complexe transcriptionnel (A-I) ou comme des compétiteurs vis-à-vis d’autres protéines (les activateurs ou répresseurs naturels), qui se fixent au niveau des régions promotrices (rectangle rouge) (A-II). Les ZF peuvent également être utilisés pour créer des enzymes chimériques (B) capables de modifier directement l’ADN, par exemple par méthylation de l’ADN lui-même (B-I) ou des histones qui sont des facteurs de remodelage de la chromatine pouvant agir soit comme activateurs, soit comme répresseurs (B-II). Les ZF conçus in vitro peuvent être utilisés comme des facteurs de transcription ciblant les régions promotrices des gènes d’intérêt (C). Dans ces cas, les nouveaux facteurs de transcription interagissant avec d’autres éléments de la machinerie transcriptionnelle et selon le domaine effecteur fusionné auront une activité d’inhibiteur (C-I) ou d’activateur (C-II) sur la transcription (d’après [21]).