Le next-generation biobanking

Un défi des données numériques

Next generation biobanking: the challenge of data

¹ Biobanques, Inserm US013, Hôpital de la Salpêtrière, 47, boulevard de l’Hôpital, 75651 Paris, France
² Université Milano-Bicocca, Piazza dell’Ateneo Nuovo, 1, 20126 Milan, Italie
³ Université Côte d’Azur, BB-0033-00025, Campus Valrose, 28, avenue de Valrose, 06108 Nice, France

^* georges.dagher@inserm.fr

Résumé

La recherche biomédicale connaît depuis le début du siècle un bouleversement de grande ampleur avec l’avènement de technologies à grand débit (les -omiques) appliquées à la biologie et associées à des approches biologiques, moléculaires ou aux techniques d’imagerie. Cette révolution méthodologique s’appuie sur l’analyse d’échantillons biologiques prélevés sur les patients puis conservés dans des biobanques. L’intégration des données massives obtenues par ces différentes technologies et leur analyse devrait permettre d’accroître nos connaissances des mécanismes complexes des pathologies humaines et une meilleure stratification des patients selon une nomenclature génétique ou moléculaire. L’accroissement exponentiel des données générées et leur complexité nécessitent cependant la mise en place d’infrastructures adaptées, de nouvelles modalités d’accès et d’échanges de ces données ainsi qu’une organisation optimisée des biobanques afin d’intégrer de nouvelles disciplines adaptées à l’analyse de ces données.

Abstract

Human biological samples are key resources in unravelling physiopathological factors underlying diseases and influencing their outcome. By making use of these resources, genomics, proteomics and molecular imaging techniques have achieved unprecedented progress in the past decade. The development of genomics platforms, molecular imaging as well as bioinformatics allowed a significant development of the biomarkers field thus realizing significant advances towards personalized medicine. The exponential increase of data, their complexity, the necessity of their integration for analysis require the development of appropriate infrastructures. These latter should integrate experts from different fields as well as an optimal organisation of biobanks including novel access and exchange rules for biological material and data.