Figure 1

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Modèles de flux de gènes testés par les D-statistiques. Les allèles ancestraux et dérivés sont désignés par respectivement A en rouge et D en bleu, la mutation par une étoile bleue. Le calcul de cette statistique nécessite quatre génomes : (1) un génome d’un groupe externe, permettant de distinguer le variant dérivé D du variant archaïque A ; (2) le génome d’une population supposée impliquée dans le flux de gènes ; et (3) et (4) les génomes de deux populations ayant potentiellement participé de façon non symétrique au flux de gènes. La statistique D compare le nombre de positions où les génomes (2) et (3) partagent le variant dérivé quand (4) a le variant ancestral (soit ADDA) au nombre de position où (2) et (4) partagent le variant dérivé quand (4) a le variant ancestral (soit ADAD). En cas de coalescence ancienne (panneau de gauche), les populations (3) et (4) ont autant de chances d’hériter du variant dérivé : le nombre de ADAD sera similaire au nombre de ADDA. En revanche, en cas de flux de gènes entre (2) et (3), le nombre de ADDA sera significativement supérieur au nombre de ADAD.

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