Comparaison des protocoles « pré-expansion » et « post-expansion ». Dans le protocole « pré-expansion », les cellules sont fixées puis immunomarquées avant d’être enrobées dans un polymère expansible. Après digestion totale du protéome par la protéinase K, les fluorochromes associés au polymère sont soumis à l’expansion par ajout d’eau. Dans le protocole « post-expansion », les cellules sont directement enrobées dans un polymère expansible. Après dénaturation partielle du protéome, les protéines ancrées au polymère sont soumises à l’expansion par ajout d’eau puis immunomarquées.