Fonctionnement de l’analyse automatisée de sections de biopsies musculaires marquées par immunofluorescence à l’aide de notre macro développée sur la plateforme Fiji. (1) La première étape consiste à améliorer l’image en éliminant le bruit de fond et en augmentant le contraste. (2) La macro va ensuite combler les écarts entre les fibres et proposer à l’utilisateur une liste de paramètres d’exclusion modifiables pour améliorer la détection des fibres et diminuer le nombre d’artefacts. (3) Chaque membrane myocytaire est identifiée grâce au marquage dystrophine/spectrine. (4) Parmi les fibres détectées, celles positives pour MyHC sont segmentées et identifiées en tant que myofibres de type II. (5) Les myofibres de type I non marquées sont ensuite calculées par différence. Les paramètres morphologiques sont calculés et les résultats sont enregistrés sous la forme d’un fichier excel (.xls). La macro sauvegarde un fichier code couleur pour la distribution des fibres selon la surface et le petit diamètre des myofibres (d’après Reyes-Fernandez et al., 2019).