Les trois types d’autophagie. 1. La macro-autophagie implique la formation d’une vésicule à double membrane appelée autophagosome. La formation du phagophore (étape d’initiation) est dépendante de kinases (ULK1, Unc-51-like autophagy activating kinase 1) et de protéines autophagiques dont ATG13 (autophagy-related gene 13). Un complexe incluant la Bécline-1 (ATG6) est impliqué dans l’étape de nucléation et d’élongation du phagophore. Le recrutement des protéines nécessaires à l’élongation et la fermeture de l’autophagosome impliquent ATG5-ATG12 et LC3 (ATG8)-PE (phosphatidyléthanolamine). La dernière phase implique la dégradation des protéines cargo, qui sont sélectivement reconnues par des adaptateurs comme p62, une protéine qui contient une région d’interaction avec LC3. 2. Dans l’autophagie relayée par les chaperonnes (CMA), les protéines qui contiennent un motif KFERQ se lient à la chaperonne Hsc70 et au récepteur LAMP-2A (lysosomal-associated membrane protein 2) pour être transloquées dans le lysosome et y être dégradées. 3. La microphagie implique une séquestration directe des composants cellulaires dans le lysosome par invagination. LC3 : microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3 ; p62 : sequestosome-1.