Mécanismes moléculaires et épigénétiques de l’expression des TRA régulés par le facteur de transcription Aire. A. Section de thymus d’une souris sauvage marquée par immunofluorescence avec un anticorps anti-kératine 14 (rouge) qui détecte les mTEC et un anticorps anti-Aire (vert). Échelle : 10 µm. B. Représentation schématique des différents domaines de la protéine Aire. À partir de l’extrémité amino-terminale : un domaine HSR/CARD permettant l’oligomérisation de Aire, une séquence NLS permettant sa localisation nucléaire, un domaine SAND dont le rôle reste à être caractérisé et deux domaines PHD (PHD1 et PHD2). PHD1 reconnaît les histones H3K4 non méthylées (H3K4me0 ; cadre rouge) et la protéine kinase dépendante de l’ADN (DNA-PK ; cadre bleu). Ce domaine est suivi d’un domaine riche en proline (PRR) et d’un domaine d’activation de la transcription (TAD) qui est impliqué dans la liaison avec le facteur d’élongation P-TEFb (cadre orange). La position des acides aminés est indiquée. C.  Mode d’action de Aire dans la transcription des TRA. Par son domaine PHD1, Aire est préférentiellement recruté aux promoteurs de gènes présentant des histones H3K4 non méthylées (H3K4me0). Ce domaine interagit également avec la DNA-PK qui reconnaît un variant d’histone H2AX (γH2AX). Cette kinase phosphoryle Aire, permettant ainsi le recrutement du facteur d’élongation P-TEFb qui, à son tour, phosphoryle le domaine carboxy-terminal (CTD) de l’ARN polymérase II (ARNpol II). Cette cascade de phosphorylations entraîne la mise en route de la phase d’élongation de la transcription des TRA.