Chémobiologie
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Figure 3.

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La base de données 2P2I-DB et ses outils associés. La base de données structurale 2P2I-DB (http://2p2idb.cnrs-mrs.fr/index.html) recense toutes les familles pour lesquelles la structure 3D des complexes protéine-protéine et protéine-inhibiteur a été caractérisée expérimentalement. Pour chaque famille, de nombreuses informations sont disponibles, telles que les caractéristiques des interfaces ou des inhibiteurs, ainsi que des liens vers d’autres sites d’interêt (UniProt, PubMed, PDBsum, PDB, ChemSpider, etc.). Les structures peuvent être visualisées et manipulées de façon interactive. Différents outils sont disponibles afin d’analyser les propriétés des interfaces protéine-protéine (2P2IINSPECTOR) ou de prédire leur « druggabilité » (2P2ISCORE). Les propriétés des inhibiteurs, ainsi que les jeux de données utilisés pour développer l’algorithme d’apprentissage qui a permis de construire la chimiothèque focalisée 2P2I3D, sont également disponibles (2P2IHUNTER).

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