PPI-Hit Profiler. A. PPI-HitProfiler est un logiciel gratuit pour prédire le potentiel de toute molécule à être un inhibiteur de cible PPI. Il est basé sur un modèle statistique (arbre de décision) reposant sur deux propriétés physicochimiques. La première décrit la forme 3D spécifique des inhibiteurs de cibles PPI (iPPI), illustrée par des valeurs plus hautes du descripteur RDF070m qui favorisent les structures chimiques ramifiées (en forme de T, de L ou surtout d’étoile). La deuxième décrit le nombre de liaisons chimiques insaturées (exemple, aromatiques) illustrée par le descripteur Ui. B. Exemple d’inhibiteur de cible PPI : nutline-2 cocristallisée avec MDM2 (Code PDB 1RV1). La forme en étoile de cette molécule, ainsi que la présence dans sa structure de 18 liaisons insaturées, illustrent les propriétés privilégiées de ce type d’inhibiteur pour moduler leur cible PPI respective. C. Validation de PPI-HitProfiler sur les données de l’iPPI-DB. PPI-HitProfiler prédit correctement 92% des composés de l’iPPI-DB avec une bonne sensibilité par cible distincte PPI pour la quasi-totalité des cibles.