Réparation par excision de nucléotides. La NER procède selon deux sous-voies chevauchantes qui se distinguent uniquement à l’étape de reconnaissance de la lésion : (1) la réparation globale (global genomic NER, GG-NER) qui éradique des lésions dans l’ensemble du génome et (2) la réparation couplée à la transcription (transcription coupled NER ; TC-NER) qui agit uniquement sur le brin transcrit des gènes actifs. Lors de la GG-NER, via leurs capacités à déceler d’importantes déformations structurales, l’hétérodimère DDB1-DDB2 et/ou le complexe hétérotrimérique XPC-HR23B-CEN2 détectent les lésions. Alternativement, lors de la TC-NER, le blocage de l’ARN polymérase au site endommagé émet le signal à l’origine du recrutement des protéines CSA (Cockayne syndrome A protein) et CSB. À la suite de l’une ou l’autre de ces étapes de reconnaissance, la voie commune de la NER est mobilisée séquentiellement de la manière suivante : (1) les ADN hélicases (XPB et XPD), composantes du facteur de transcription TFIIH, déroulent la double hélice d’ADN ; (2) les protéines RPA (replication protein A) et XPA sont sollicitées afin de permettre la stabilisation du complexe et le recrutement des facteurs subséquents ; (3) l’arrivée des endonucléases XPG et XPF-ERCC1 mène à l’incision de la lésion en 3’ et 5’ respectivement et l’oligonucléotide endommagé (~20 bp) est excisé ; (4) l’ADN est resynthétisé par des facteurs de réplication, incluant les polymérases ε/δ, et finalement lié à nouveau par des ligases.