Structure en triple hélice (PNA)2/DNA. L’hybridation de deux molécules de PNA avec un brin d’ADN complémentaire entraîne le déplacement de l’autre brin d’ADN qui va ainsi former une boucle d’ADN simple brin (D-loop). Dans le triplex formé entre les deux PNA et le brin d’ADN, l’un des brins PNA est lié à l’ADN par des liaisons hydrogènes classiques de type Crick et Watson, et l’autre par des liaisons hydrogènes de type Hoogsteen (les liaisons entre les bases sont représentées par des traits verts).