Figure 2.

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Stratégies d’identification bactérienne et d’exploration métagénomique par clonage et séquençage de grands fragments d’ADN génomique. À partir d’un échantillon complexe de l’environnement ou d’un enrichissement obtenu par culture, l’ADN génomique total est extrait, des fragments de haut poids moléculaire sont insérés dans des vecteurs BAC (bacterial artificial chromosome) ou fosmides, puis transformés dans E. coli. Des banques de clones contenant les inserts de haut poids moléculaire sont ainsi construites. Le séquençage à haut débit couplé à l’analyse bio-informatique des séquences obtenues permet d’étudier des milliers de gènes et d’opérons différents. Les clones contenant les gènes d’intérêt sont criblés sur milieux appropriés pour la recherche de nouvelles activités. Le criblage de ces banques pour les gènes de l’ARNr 16S permet d’identifier l’organisme responsable des activités à haute valeur ajoutée. Ainsi sont reliées les deux approches, phylogénétique et génomique.
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