Principaux rétrotransposons. A. Rétrotransposon de type non viral, tel que les LINE (long interspersed nuclear element), dépourvu de LTR (long terminal repeat) et contenant deux cadres de lecture ouverts (ORF1 et ORF2, open reading frame 1 and 2). L’ORF 1 code pour des protéines de type Gag, tandis que l’ORF 2 porte les séquences codant pour les protéase, transcriptase inverse, RNAse H et intégrase caractéristiques des rétrovirus. B. Rétrotransposon de type viral délimité par des LTR, mais dépourvu du gène env, tel que les rétrotransposons Ty de levure, Copia de drosophile et certaines séquences endogènes rétrovirales (ERV). C. Rétrovirus infectieux, de type exogène ou endogène, arborant les trois cadres de lecture gag, pol et env [5].