Les virus des bactéries à l’ère de l’Anthropocène : amis ou ennemis de leurs hôtes ?

Bacterial viruses in the Anthropocene era: friends or enemies of their hosts ?

¹ Laboratoire de Chimie Bactérienne, UMR7283, Institut de microbiologie de la Méditerranée, CNRS, Aix-Marseille Université, Marseille, France
² INRAE, université de Bordeaux, UMR 1366 oenologie, Bordeaux INP ISVV, Bordeaux, France

^* mireille.ansaldi@cnrs.fr

Résumé

Les virus de bactéries, ou bactériophages, sont les virus les plus abondants sur Terre, et leurs hôtes sont les organismes vivants les plus répandus dans la biosphère. Ils sont retrouvés à l’état libre, sous forme de virions, et aussi très abondants dans les génomes de bactéries, à l’état de prophages. Les bactériophages sont présents dans tous les biotopes colonisés par les bactéries, eaux, sols, environnements extrêmes, microbiotes humains, animaux et végétaux, où ils participent aux échanges génétiques. Tous les facteurs qui impactent ces environnements ont donc des conséquences importantes sur la dynamique des populations de bactéries et de leurs virus.

Abstract

Bacterial viruses, or bacteriophages, are the most abundant viruses on Earth, and their hosts are the most widespread living organisms in the biosphere. They are found in a free state, as virions, but are also very abundant in bacterial genomes, as prophages. Bacteriophages are present in all biotopes colonized by bacteria, such as water, soils, extreme environments, human, animal, and plant microbiomes, where they contribute to genetic exchanges. Therefore, all factors affecting these environments have a major impact on the dynamics of bacterial populations and their viruses.