Place des analyses génomiques centralisées dans la découverte et la validation d'innovations diagnostiques en oncologie

Genomics and progress in oncology

Chef de Projet, Ipsogen, Luminy Biotech Entreprises, Case 923, 163, avenue de Luminy, 13288 Marseille Cedex 9, France.

^* martinec@ipsogen.com

Résumé

La génomique et la génétique sont en train de devenir des piliers de la recherche clinique permettant de comprendre certaines maladies au niveau moléculaire et d'améliorer les traitements. Cependant, la réalisation d'analyses génomiques dans le cadre d'études cliniques en oncologie soulève un certain nombre de problèmes liés aux procédés de recueil des échantillons, à la nécessité de procéder à des étapes pré-analytiques sur les sites cliniques et à la fragilité des molécules à analyser. La mise en place d'une logistique adaptée à l'identification et la validation de biomarqueurs issus des technologies génomiques nécessite de maîtriser les technologies utilisées en aval et requiert une intégration forte de tous les acteurs impliqués ; centre de soins, sociétés de biotechnologies et/ou industrie pharmaceutique.

Abstract

Genomics and genetics are becoming pillars of clinical research, allowing certain diseases to be understood at the molecular level and leading to improved treatments. Successful genetic analyses in the clinical oncological setting depend on the quality of the samples collected. At clinical sites, attention must be paid to the steps taken prior to analysis, and to the fragility of the molecules to be tested. The development of a standard procedure specifically adapted to the identification and validation of biomarkers through genomics requires an understanding of the different technologies used at each time point, from the analysis to the data processing, and the implication of personnel at ail levels: the health care centers, the biotech companies, and/or the pharmaceutical industries.