Description des deux méthodes de RNA-seq utilisées dans le cadre de l’étude de l’hétérogénéité phénotypique. A. Schéma d’observation d’une population clonale au microscope présentant une hétérogénéité phénotypique. B. Comparaison des méthodes de MATQ-seq et de PETRIseq. Le MATQ-seq est réalisé en plusieurs étapes : isolement des bactéries par cytométrie en flux, lyse des cellules, rétrotranscription de l’ARNm en ADNc avec un code barre unique, ajout d’une queue poly(C), amplification et séquençage. Le PETRI-seq est réalisé par perméabilisation des cellules, séparation dans différents puits, rétrotranscription de l’ARNm en ADNc, ajout d’un code barre unique associé au puits, regroupement des cellules et nouvelle séparation afin de répéter l’étape d’ajout du code barre deux fois. Les cellules sont enfin lysées pour préparer la librairie d’ADNc avant séquençage.