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Tableau I.
Gènes chromosomiques régulés par LexA et séquence de leur boîte SOS. * Les parties soulignées dans les séquences LexA de dinG et recN(3) montrent qu’elles diffèrent du motif consensus « CTG ».
| Gène | Fonction/produit | Site de fixation de LexA* |
|---|---|---|
| Réplication et réparation | ||
| polB | ADN polymérase II | GACTGTATAAAACCACAGCC |
| dinB | ADN polymérase IV | CACTGTATACTTTACCAGTG |
| umuDC | ADN polymérase V (UmuC) ; UmuD’ forme un complexe avec UmuC | TACTGTATATAAAAACAGTA |
| uvrB | Réparation de l’ADN par excision ; nucléase d’excision sous-unité B | AACTGTTTTTTTATCCAGTA |
| uvrA | Réparation de l’ADN par excision ; nucléase d’excision sous-unité A | TACTGTATATTCATTCAGGT |
| cho (ydjQ) | Réparation de l’ADN par excision ; endonucléase | CACTGGATAGATAACCAGCA |
| recN (1) | Réparation de l’ADN par recombinaison | TACTGTATATAAAACCAGTT |
| recN (2) | Réparation de l’ADN par recombinaison | TACTGTACACAATAACAGTA |
| recN (3) | Réparation de l’ADN par recombinaison | TA ATG GTTTTTCATACAGGA |
| ruvAB | Réparation de l’ADN par recombinaison ; hélicase | CGCTGGATATCTATCCAGCA |
| uvrD | Réplication de l’ADN, réparation de mismatch ; hélicase II | ATCTGTATATATACCCAGCT |
| dinG | Hélicase ATP-dépendante | TATTGGCTGTTTATACAGTA |
| ssb | Réplication de l’ADN, recombinaison | ACCTGAATGAATATACAGTA |
| sbmC | Inhibiteur de l’ADN gyrase | TACTGTATATAAAAACAGTA |
| Régulateur de la réponse SOS | ||
| lexA/dinF (1) | Répresseur du régulon SOS | TGCTGTATATACTCACAGCA |
| lexA/dinF (2) | Répresseur du régulon SOS | AACTGTATATACACCCAGGG |
| recA | Clivage du répresseur, mutagenèse et recombinaison homologue | TACTGTATGCTCATACAGTA |
| Division cellulaire | ||
| sulA | Inhibition de la division cellulaire | TACTGTACATCCATACAGTA |
| ftsK | Protéine essentielle à la division cellulaire | TCCTGTTAATCCATACAGCA |
| Toxine/antitoxine | ||
| tisAB (ysdAB) | TisB : peptide toxique induit par la réponse SOS | TACTGTTTATTTATACAGTA |
| symE (yjiW) | Protéine toxin-like de la réponse SOS | TACTGATGATATATACAGGT |
| hokE | Homologue des gènes hok (host killing) ; interrompu par IS186 | CACTGTATAAATAAACAGCT |
| Autres fonctions | ||
| dinI | Protéine I, inductible par dommages à l’ADN | ACCTGTATAAATAACCAGTA |
| ydjM | Protéine de membrane interne (prédiction) | TACTGTACGTATCGACAGTT |
| pcsA (dinD) | Protéine inductible par dommages à l’ADN | AACTGTATATAAATACAGTT |
| yebG | Protéine conservée régulée par LexA | TACTGTATAAAATCACAGTT |
| dinQ | Protéine inductible par dommages à l’ADN | TACTGTATGATTATCCAGTT |
| dinS | Protéine conservée de l’IS150 | AGCTGTATTTGTCTCCAGTA |
| ybfE | Protéine régulée par LexA | AACTGATTAAAAACCCAGCG |
| molR | Régulateur du métabolisme du molybdate | AACTGGATAAAATTACAGGG |
| Consensus boîte SOS | TACTGTATATATATACAGTA | |
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