Les PRE, modules de régulation épigénétique conservés au cours de l’évolution. A. Modèle d’apposition/reconnaissance des marques épigénétiques par les complexes multiprotéiques composés des protéines du PcG (bleu) et du trxG (violet). La majorité des protéines du PcG/trxG ne se fixent pas directement à l’ADN, mais à la chromatine. Regroupées dans des complexes répresseurs ou activateurs (PRC2 ou TAC1), elles modifient la région N-terminale des histones (ligne courbe noire) par l’addition de groupements méthyl, acétyl, phosphate, ubiquitine… La combinaison de ces modifications et leur position constituent une empreinte épigénétique répressive (disque rouge) ou activatrice (étoile verte) lue par d’autres complexes du PcG/trxG (PRC1, BRM). Un petit nombre de facteurs du PcG/trxG lie directement l’ADN sur les motifs PHO (barre rouge, PHO-B : PHO ou PHOL), GAGA (barre verte, GAF-B: GAF/TRL ou PSQ), ou DSP1 [13] (non figuré) requis pour la reconnaissance et la fonction des PRE. Ils permettent la reconnaissance et l’ancrage des cibles régulées par les facteurs du PcG/trxG, et serviraient d’adaptateurs pour le recrutement des autres protéines du PcG/trxG. B. L’analyse des séquences autour des points de cassure de l’inversion chromosomique kreisler chez la souris révèle une région de 450 bp (rectangle en jaune) conservée chez la souris, l’homme et le poulet. Elle contient des motifs de fixation pour les protéines PHO/PHOL (rouge) et GAF/TRL ou PSQ (vert), motifs habituellement trouvés dans les PRE chez la drosophile, ce qui en fait un candidat pour un PRE chez les mammifères, dénommé PRE-kr. C. Test de validation fonctionnelle d’un PRE chez la drosophile. Le transgène [11] contient la séquence PRE-kr excisable (∆PRE, système Cre-lox, losanges verts) en amont de deux gènes rapporteurs dont l’activité est mesurable chez les larves (lacZ qui code la ß-galactosidase, inductible par le système UAS/Gal4) et les adultes (miniwhite qui est requis pour le dépôt des pigments dans l’œil). La présence du PRE-kr réprime les deux rapporteurs. L’excision du PRE-kr restaure leur expression (en haut). Le PRE-kr perd son activité répressive si la dose d’une des protéines du complexe PRC1 ou de PHO est réduite. Si celle de GAF/TRL est diminuée, l’activité des rapporteurs est encore plus réduite, ce qui suggère que les motifs GAGA sont fonctionnels et requis pour l’activité du PRE. Modifié d’après Sing et al. [4].