Évolution des relations phylogénétiques au sein des Deutérostomiens en fonction du type de caractères utilisés pour les reconstruire. A. Représentation classique reposant sur la morphologie et guidée par l’idée de complexification croissante avec apparition successive des fentes branchiales, de la chorde, puis de la segmentation du mésoderme en somites. B. Image phylogénétique proposée par l’étude de l’ARN ribosomique révélant une proche parenté entre Échinodermes et Hémichordés [5]. Ce schéma évolutif implique que les fentes branchiales étaient vraisemblablement déjà présentes chez l’ancêtre des Deutérostomiens. C. Phylogénie obtenue par l’analyse phylogénomique de 146 gènes nucléaires [4] identifiant les Tuniciers comme les plus proches parents des vertébrés et suggérant une proche parenté entre Céphalochordés et Échinodermes, les Hémichordés n’étant pour l’instant pas inclus dans cette analyse (pointillés). Cette hypothèse suppose que l’ancêtre des Deutérostomiens était probablement bien plus complexe que ce qui a été généralement postulé, avec des fentes branchiales et des caractères de type chordé comme la présence d’une chorde et de somites. L’apparition (symboles pleins) ou la perte (symboles vides) de ces différents caractères au cours de l’évolution est indiquée.