La prolyl isomérisation du domaine carboxy-terminal (CTD) de Rpb1 pourrait aboutir à une modulation de ses propriétés. A. La peptidyl-prolyl isomérase Pin1 reconnaît certains motifs sur le CTD phosphorylé de la plus grande sous-unité de l’ARN polymérase II. B. Pin1 se fixe à ces motifs et effectue une prolyl isomérisation de certains liens pS-P ou pT-P du CTD, induisant un changement structural. C et D. Les changements structuraux du CTD produits par la fixation de Pin1 pourraient permettre la liaison de certaines protéines (X et Y). Les protéines (X et Y) candidates à la fixation au CTD après son remodelage peuvent être des phosphatases, des facteurs d’épissage, des facteurs de maturation des ARNm (coiffage, polyadénylation, clivage), des kinases, des ubiquitine ligases.