Modèle du contrôle de la persistance du virus SARS-CoV-2 dans les macrophages alvéolaires du poumon. 1. Chez les macaques infectés par le SARS-CoV-2, le virus persiste dans les macrophages alvéolaires activés du poumon, extraits du liquide broncho-alvéolaire (BALF), et peut se propager de cellule à cellule par des prolongements macrophagiques ressemblant à des nanotubes. 2. La réplication du virus SARS-CoV-2 est inhibée par l’interféron γ (IFN-γ) qui est produit notamment par les lymphocytes T CD8⁺/NKG2R⁺ et par les cellules natural killer (NK) NKG2Alo. La production d’IFN-γ par les cellules NK est toutefois diminuée. 3. L’IFN-γ augmente la présence de la molécule du complexe majeur d’histocompatibilité de classe E (CMH-E) à la surface des macrophages activés. Le CMH-E présente le peptide V3-11 de la protéine Spike de SARS-CoV-2 aux lymphocytes. L’interaction du complexe moléculaire formé par le CMH-E et le peptide V3-11 avec les cellules NK bloque leur activité. 4. Chez certains individus, les cellules NK « adaptatives » échappent à cette inhibition impliquant le CMH-E par des mécanismes encore mal compris, ce qui permet l’élimination des cellules infectées par le SARS-CoV-2, et diminue ainsi le réservoir viral persistant.