Figure 1.

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Principe d’étude de la communication intercellulaire et utilisation d’ICELLNET. A. Schéma créé par BioRender.com illustrant le contexte biologique d’une cellule dendritique (cellule A) communiquant avec deux lymphocytes T dans des états biologiques différents (cellules B et C). B. Schéma créé par BioRender.com des étapes expérimentales nécessaires à l’obtention des profils transcriptomiques de chaque population cellulaire pour appliquer ICELLNET. C. Schéma représentant le score de communication global entre les cellules A et B, et A et C, obtenu avec ICELLNET. D. Diagramme représentant la contribution de chaque famille de molécules aux scores de communication obtenus avec ICELLNET. CMH : complexe majeur d’histocompatibilité. E. Graphique représentant les interactions ligand-récepteur qui contribuent le plus à la différence de communication observée entre les cellules A et B d’une part, et les cellules A et C d’autre part. TXLNA : α-taxiline ; STX1A : syntaxine-1A ; TNFSF9, TNFSF10 : membres de la superfamille du facteur de nécrose tumorale ; TNFRSF9, TNFRSF10D : membres de la superfamille du récepteur du facteur de nécrose tumorale ; IL-16 : interleukine 16 ; CD4 : cluster de différenciation 4 ; CXCL9, CXCL16 : chimiokines 9 et 16 (ligands des récepteurs CXCR3 et CXCR6, respectivement) ; CXCR3, CXCR6 : récepteurs des chimiokines 4 (CXCR3-B), 9, 10, 11 (CXCR3-A et -B) et 16 (CXCR6) ; HLA-DRA, HLA-DRB5 : chaîne α et chaîne β5 des antigènes d’histocompatibilité de classe II HLA-DR ; LAG3 : gène d’activation lymphocytaire 3.
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