La colonisation microbienne précoce détermine l’homéostasie des MAIT et le dialogue entre MAIT et microbiote module leur fonction. L’intestin est colonisé précocement en période post-natale par un microbiote composé de bactéries commensales. Celles-ci expriment des métabolites dérivés de la riboflavine. Plus ces bactéries seront nombreuses, plus la représentation des MAIT tissulaires, ici dans la peau, sera grande. Les MAIT se développent dans le thymus et requièrent l’IL-23 pour leur accumulation. En cas de lésion cutanée, les cellules présentatrices d’antigène (CPA) recruteront des cellules MAIT via MR1 ou via la sécrétion d’IL-18. Cette activation des MAIT induit la production d’autres interleukines comme l’IL-17, et améliore la cicatrisation cutanée.