La signature IFN est aussi présente chez les patients atteints de maladies auto-immunes. Dans l’exemple illustré ici, des patients lupiques peuvent être divisés selon le niveau d’expression des gènes induits par l’IFN. L’analyse transcriptomique par microarray de 21 gènes à partir d’échantillons sanguins d’individus contrôles stimulés ou non par l’IFN donne un score d’expression qui, par traitement mathématique (algorithme de regroupement hiérarchique non supervisé), permet de définir une signature IFN. L’analyse des échantillons sanguins de patients lupiques permet, en les comparant aux échantillons contrôles, de les séparer en deux groupes avec une signature IFN négative ou positive. SLE : systematic lupus erythematosus (adapté de [15]).