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Tableau I.
Approches méthodologiques et outils déployés dans les unités du RIIP-Palu. RCA : République centrafricaine.
| Sites d’études | Madagascar IPM |
Cambodge IPC |
Guyane IPG |
Côte d’Ivoire IPCI |
Sénégal IPD |
RCA IPB |
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Méthodologie d’étude | Collaboration avec le PNLP – réseau d’étude de la résistance (RER) dans plusieurs sites sentinelles | Collaboration avec le PNLP – réseau de sites sentinelles | Centre national de référence | Collaboration avec le PNLP | Suivis de cohorte et études épidémiologiques | Collaboration avec le PNLP – centres de santé, Bangui | |
| P. falciparum | Suivi d’efficacité thérapeutique | Collaboration avec le PNLP – protocole OMS | Collaboration avec le PNLP, l’OMS et les équipes de recherche – protocole OMS et autres protocoles de recherche | Collaboration avec les hôpitaux et InVS | Collaboration avec le PNLP – protocole OMS | Suivis de cohortes, études transversales |
Collaboration avec la PNLP – protocole OMS |
| Étude de la susceptibilité ex vivo / in vitro | Techniques isotopique et fluorimétrique | Techniques isotopique et microscopique (RSA) | Technique isotopique | – | Technique isotopique | Technique isotopique | |
| Adaptation d’isolats en culture | Non | Oui | Oui, clonage | Non | Non | Non | |
| Marqueurs moléculaires | PCR/RFLP PCR/séquencage PCR/HRM Pfcrt, Pfmdr-1, Pfdhfr/dhps, Pfnhe qPCR : nombre de copies du gène Pfmdr-1 |
PCR/séquencage Pfcrt, Pfmdr-1, Pfdhfr/Pfdhps, Pfcytb, Pfnhe, PfATPase6 qPCR : nombre de copies du gène Pfmdr-1 PCR-LDR FlexiChip Séquençage Illumina ( Whole genome sequencing ) |
PCR/séquençage Pfcrt, Pfmdr-1, Pfdhfr/dhps, Pfcytb, PfATPase6, Pfcg2 Microsatellites qPCR : nombre de copie du gène Pfmdr-1 RT-PCR Pfmdr1 |
PCR/séquencage Pfcrt, Pfmdr-1, Pfdhfr/dhps, PfATPase6 |
PCR/séquencage Pfcrt, Pfmdr-1, Pfdhfr/dhps, Pfcytb, PfATPase6 |
PCR/RFLP
Pfcrt, Pfmdr-1, Pfdhfr/dhps |
|
| P. vivax | Suivi d’efficacité thérapeutique | Collaboration avec la PNLP – réseau d’étude de la résistance (RER) | Collaboration avec le PNLP, l’OMS et les équipes de recherche – protocole OMS et autres protocoles de recherche | Collaboration avec les hôpitaux et InVS | Non | Non | Non |
| Étude de la susceptibilité ex vivo | Non | Technique microscopique et ELISA | Technique microscopique | Non | Non | Non | |
| Adaptation d’isolats en culture | Non | Non | Non | Non | Non | Non | |
| Marqueurs moléculaires | PCR/séquencage Pvcrt, Pvmdr-1, Pvdhfr/dhps qPCR (nombre de copies du gène Pvmdr-1 ) | PCR/séquencage Pvcrt, Pvmdr-1, Pvdhfr/dhps qPCR (nombre de copies du gène Pvmdr-1 ) | En cours | Non | Non | Non | |
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