Banque inductible d’ARN en « épingle à cheveux » (short hairpin RNA, shARN) utilisée pour découvrir le « talon d’Achille » des myélomes multiples. Les plasmides composant la banque de shARN sont produits sous forme de surnageant rétroviral qui nous sert à infecter les lignées de myélome multiple. Cette banque se compose, entre autres, d’un grand nombre de facteurs de transcription, de toutes les kinases connues, de molécules pro- et anti-apoptotiques, et de gènes dont l’expression varie selon le type de lymphome mais dont la fonction reste à définir. Nous avons utilisé un système inductible car les shARN qui inhibent l’expression de tels gènes peuvent s’avérer toxiques pour la cellule. En principe, chaque cellule n’est infectée que par un seul rétrovirus, ce qui implique qu’un gène unique, différent pour chaque cellule, est éteint lors de l’induction des shARN. À chaque shARN est associé un « code barre » de 60 nucléotides qui lui est spécifique. Ce code barre permet par la suite de retrouver les clones qui ont proliféré ou au contraire ont disparu par rapport à une culture témoin. Après avoir sélectionné les cellules qui expriment la banque rétrovirale, les cellules sont divisées en deux sous-populations, l’une dont l’expression des shARN est induite, et l’autre, non induite, qui sert de contrôle négatif. Les cellules qui expriment un shARN inhibant l’expression d’un gène indispensable à leur prolifération ou à leur survie disparaissent de la population de cellules infectées. Après 21 jours de traitement, l’ADN génomique des cellules induites et non induites est purifié, et la séquence du code barre est amplifiée par PCR. Les produits de PCR des cultures induites et non induites sont marqués à l’aide de fluorochromes différents et co-hybridés sur des puces à ADN éditées avec les séquences de 60 nucléotides des codes barres. L’intensité du signal fluorescent reflète alors l’abondance de chaque shARN dans les cultures induites et non induites et désigne les gènes dont l’expression est indispensable à la prolifération et à la survie des myélomes.