Le génome et les protéines du VHC. A. Le génome viral consiste en un ARN simple brin positif de 9,6 kb. Il code pour une polyprotéine d’environ 3 000 acides aminés. Cette région codante est encadrée en 5’ par une séquence non codante de 341 nucléotides (nt), contenant un site d’entrée du ribosome (IRES), et en 3’ par une séquence non codante essentielle à la réplication virale, de longueur variable. La polyprotéine virale est clivée pour former des protéines structurales (la protéine de core et les deux protéines d’enveloppe E1 et E2), servant à l’assemblage du virus, et les protéines non structurales (de NS2 à NS5b), servant à la maturation de certains domaines de la polyprotéine et à la formation d’un complexe de réplication de l’ARN viral. Ces protéines non-structurales et structurales sont séparées par une petite protéine hydrophobe appelée p7, dont le rôle structural ou non structural n’est pas encore bien précisé. Les protéines structurales sont engendrées par un clivage réalisé entièrement par des peptidases cellulaires présentes au niveau du réticulum endoplasmique (RE), alors que les protéines non structurales sont produites par la protéase virale (NS2/NS3). B. Les protéines structurales sont associées à la membrane du RE grâce à une succession de peptides d’initiation et de terminaison de transfert dans la polyprotéine. Sur la face luminale du RE, la peptidase cellulaire du signal libère les protéines d’enveloppe E1 et E2. La protéine de core subit un clivage additionnel par la peptidase du peptide signal, ou SPP (signal peptide peptidase).