La séparation du complexe HoxD en deux entraîne une partition des domaines d’expression. La structure du complexe est indiquée schématiquement, l’inversion cassant le complexe entre Hoxd11 et Hoxd10 sépare chaque partie par ~3 Mb. Les domaines de co-expression sont indiqués par des barres de couleur différentes. L’expression des gènes Hoxd11 et Hoxd10 est analysée par hybridation in situ. Dans un contexte normal, ces deux gènes sont co-exprimés dans des domaines distaux (autopode) et proximaux (zeugopode) des membres, dans le bourgeon génital (flèche) et dans la hernie intestinale (pointe de flèche). Après cassure du complexe, Hoxd11 est exprimé seulement dans l’autopode et le bourgeon génital, alors qu’à l’inverse Hoxd10 n’est détecté que dans l’intestin et le zeugopode. Ces expériences permettent de positionner les enhancers (ovales de couleur) associés à ces différents domaines d’expression, soit d’un côté, soit d’un autre du complexe.