Stratégies d’études des complexes ribonucléoprotéiques. Le plus souvent, un des deux partenaires du complexe est connu (l’ARN ou la protéine). A. La structure de l’ARN est spécifiquement reconnue par les deux premiers domaines de liaison à l’ARN de la nucléoline. B. Structure des deux premiers domaines de liaison de la nucléoline à l’ARN. C. Structure du complexe formé par ces deux domaines avec leur cible ARN. Si la séquence d’ARN est identifiée, on peut alors utiliser différentes techniques (chromatographie d’affinité, triple hybride, criblage d’une banque d’expression) pour identifier la protéine cible. Si la protéine du complexe ribonucléoprotéique (RNP) est connue, des expériences d’immunoprécipitation peuvent fournir des sondes pour cribler des micropuces portant des séquences de différents gènes ou être utilisées dans des expériences de SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) afin d’identifier les séquences ARN cibles. Les complexes RNP peuvent aussi être purifiés par des techniques biochimiques, puis les protéines du complexe peuvent être identifiées grâce aux techniques de protéomique.