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Figure 1.

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Stratégie de séquençage du chromosome 14. Ce schéma représente les différentes étapes du processus utilisé pour la sélection des clones à séquencer. A. Étape d’initiation: 162 « balises » (courts fragments de séquence connue) sont sélectionnées le long du chromosome 14. B. Les BAC (bacterial artificial chromosome) d’initiation correspondants à ces balises sont identifiés, par hybridation, à partir de la banque de clones construite pour l’ensemble du génome. C. La séquence des BAC d’initiation (obtenue selon D, E, F) sert alors à identifier dans la banque, pour chacun, un ensemble de BAC dont deux seront retenus pour étendre le séquençage dans les deux sens. D. Le séquençage de tous les clones BAC est réalisé par fractionnement en segments de quelques kilobases, sous-clonés en vecteur plasmide et séquencés aux extrémités. La combinaison de 1000 à 1500 lectures permet pour chacun de construire un assemblage préliminaire (E), servant de base aux opérations de finition (F). Le processus C, D, E, F est réitéré jusqu’à la fusion des groupes adjacents.

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