Réplicons subgénomiques du VHC. Les réplicons subgénomiques contiennent de 5’ en 3’ : la séquence IRES du VHC, le gène codant pour la phosphotransférase de la néomycine (néo), la séquence IRES du virus de l’encéphalomyocardite (ECMV), les séquences codant pour les protéines non structurales NS2 à NS5B et la région 3’ non codante du VHC. Ces réplicons sont dits «bicistroniques» car la synthèse de la phosphotransférase est dirigée par l’IRES du VHC, tandis que celle des protéines non structurales par l’IRES de l’ECMV. Après transfection des ARN dans des lignées hépatocytaires, la sélection est effectuée par l’ajout de néomycine. Comme la transfection n’est effectuée qu’avec l’ARN, seuls les clones cellulaires contenant des réplicons fonctionnels qui ont la capacité de se répliquer sont résistants à la néomycine.